In der Bundesrepublik Deutschland gibt es rund 550 landwirtschaftliche Biogasanlagen sowie 27 größere Zentralanlagen (Funke, 1999). Die meisten Anlagen wurden bisher in Bayern und Baden-Württemberg errichtet.
Als Substrat zur Biogaserzeugung wird die bei der Tierhaltung anfallende Gülle/ Mist verwendet. Um die Gasausbeute zu erhöhen, werden vielfach auch andere organische Reststoffe, sogenannte Co-Substrate, zugesetzt.

Das Funktionsprinzip einer Biogasanlage ist einfach (siehe Abbildung 1): Die Gülle bzw. der Mist gelangt zusammen mit den eventuell zusätzlich eingesetzten Co-Substraten zum Vergären in den Fermenter (Reaktor). Dieser Fermenter besitzt bei den meisten Biogasanlagen der Landwirtschaft ein Volumen von 150 bis 500 m³. Im Fermenter verweilt das Substrat mehrere Tage, wobei durch die Aktivität der Mikroorganismen Biogas gebildet wird. Um die Bildung von Schwimmdecken und Sinkschichten zu verhindern, muss das Substrat ständig gerührt werden. Dadurch wird zusätzlich das Entweichen der entstanden Gase erleichtert. Die Menge gebildeten Gases hängt neben dem Substrat von der Verweildauer und der Betriebstemperatur ab. Deshalb verbleibt das Substrat um so länger im Gärtank, je geringer die Temperatur ist. Die meisten Anlagen werden im mesophilen Temperaturbereich gefahren, d.h. bei etwa 35°C. Das vergorene Substrat gelangt im Anschluss in ein Endlager, das möglichst geschlossen sein sollte, da auch hier noch einmal Biogas gewonnen werden kann. Die Verweildauer im Gärtank wird jedoch maßgeblich darüber festgelegt, wie bei höchstem Durchsatz das meiste Biogas gewonnen werden kann.
Das frisch erzeugte Biogas muss zunächst gereinigt werden: Durch Zufuhr von Sauerstoff wird es entschwefelt und anschließend in einem Kondensatabscheider getrocknet. Bis zur Verbrennung wird das Biogas dann zum Beispiel in flexiblen Folienkissen gelagert.

Abbildung 1: Schema einer landwirtschaftlichen Biogasanlage (aus: Köttner, 1998)